CrispPR-GPT

kunstmatige intelligentie (AI) speelt een steeds grotere rol bij de CRISPR-Cas-technologie voor DNA-bewerking. De complexiteit en hoeveelheid data die gepaard gaan met genetische bewerkingen zijn zo groot dat AI een onmisbaar hulpmiddel wordt voor onderzoekers.

Toepassingen van AI bij CRISPR
AI wordt op verschillende manieren ingezet om CRISPR-technologie te verbeteren:

• Optimalisatie van de ‘moleculaire schaar’: CRISPR is als een moleculaire schaar, maar deze schaar kan soms op ongewenste plekken knippen, wat bekend staat als ‘off-target’ effecten. AI-modellen worden getraind met grote datasets om te voorspellen waar deze ongewenste knippen kunnen optreden. Zo kunnen wetenschappers de RNA-gidsen die de ‘schaar’ sturen, ontwerpen voor maximale precisie en minimale onbedoelde mutaties.
• Verbetering van de efficiëntie: AI helpt bij het voorspellen welke CRISPR-Cas9 varianten het meest effectief zijn voor specifieke genetische bewerkingen. Dit versnelt het onderzoek aanzienlijk, omdat het de tijdrovende ’trial-and-error’ methode vermindert.
• Ontwerp van nieuwe genetische hulpmiddelen: Generatieve AI-modellen, zoals die ook worden gebruikt in de kunst en tekst, kunnen worden ingezet om geheel nieuwe Cas-eiwitten te ontwerpen die nog preciezer en veiliger zijn dan de bestaande. Dit opent de deur naar geavanceerdere en therapeutische toepassingen.
• Versnelling van gentherapieën: Door de integratie van AI kan het hele proces van het ontwerpen en testen van gentherapieën, van de eerste experimentele fase tot klinische toepassingen, aanzienlijk worden versneld. Een voorbeeld hiervan is CRISPR-GPT, een groot taalmodel dat experimenten versnelt en toegankelijker maakt voor zowel beginners als experts.